L'ethnographie en 4 étapes (1999 - 2007)
Le Cabinet d'histoire naturelle de Charles Daniel de Meuron
Réaménagé d'une manière à la fois plus spectaculaire et plus fidèle à la collection et à la classification du XVIIIe siècle, le Cabinet d'histoire naturelle évoque les origines du Musée d'ethnographie de Neuchâtel.
Salle consacrée à l'évocation de l'ethnographie à prétention scientifique qui s'est développée dans le courant du XXe siècle afin d'appuyer sur le plan de la culture matérielle des théories anthropologiques telles que l'évolutionnisme, le diffusionnisme, l'écologie culturelle ou l'ethnotechnologie.
Mise en scène de huit très belles pièces d'ethnographie pour les uns, d'arts primitifs ou premiers pour les autres.
Le Cabinet de curiosités du XXIe siècle
Cette salle est entièrement consacrée aux objets industriels acquis et enregistrés par le MEN depuis 1984 pour figurer dans les expositions temporaires organisées depuis lors ainsi qu'à un certain nombre d'objets techniques dont le statut oscille entre celui de l'obsolescence et du souvenir, voire de l'objet de musée technique.